quote:
Originally posted by KRoN:
По скупым сведениям, просачивающимся из лаборатории во внешний мир, основная работа сосредоточена над особой микросхемой, принцип действия которой совмещает в себе квантовую физику с электроникой и биологией. Именно с её помощью станет возможно сверхбыстрое (в 200 раз) по современным меркам чтение генов.
Ну наши тоже чего-то мастерят. Вот, в фидо пробегало:
AB>> Полностью. Бо экзоны - это ж надо кДHКовые библиотеки скринировать,AB>> да из разных тканей, да все равно никогда не будешь уверенным, чтоAB>> ничего не зевнул... А так - гонишь себе чохом контиги, из хромосом -AB>> BAC'и с PAC'ами, из них - космиды, из них - плазмиды... СеквенируешьAB>> да через какой-нить ContigMaker прогоняешь. Миллиард долларов, десятьAB>> тысяч китайцев - и ништяк. А вот когда Мирза с Робертом сделают своиAB>> чипы - вот тогда круты мы будем немеряно.DAR> Извини за чайниковский вопрос, а что за чипы?
О. Это круть немеряная. Исходная идея такая. Берем маленькую основу, пришиваем
к
ней в строгом порядке все возможные октануклеотиды (исходно именно так), макаем
это дело в раствор какого-то фрагмента ДHК (чистого), отжигаем, сканируем,
прогоняем через комп и получаем на выходе сиквенс. Раз окта - значит,
теоретически, за проход 65 килобаз. Удельная стоимость сиквенса снижается,
ориентировочно, на порядок, по сравнению с лучшими нынешними достижениями
традиционных методов (Сэнгера и Максама-Гилберта-Свердлова). Проблему, даже
теоретически, будут представлять вырожденные последовательности - повторы,
тракты
и т.п. Потому как пока не получается делать это количественно - т.е., можно
только
сказать, что ячейки такие-то отгибридизовались, а такие-то - нет, а сказать
"ячейка А отгибридизовалась в х раз сильнее ячейки Б, следовательно,
октануклеотидная последовательность А представлена в этом фрагменте в х раз
больше
последовательности Б" - нельзя
. И матанализ спотыкается (там, в основном,
теория графов используется).
Это идеал, которого пока, насколько я понимаю, достичь не удается, хотя
работают
активно. Hад этим работает Мирза (Андрей Дарьевич Мирзабеков, директор
Института
молекулярной биологии в Москве).Есть же уже, и можно купить, диагностикумы на
какие-то конкретные гены, позволяющие в один проход понять, какой именно
аллельный
вариант у теб в руках. Что уже немало. Стоит прилично, но покупают.Продает,
например, Amersham Pharmacia Biotech (но делает кто-то еще, и сделано совместно
с
Мирзой).
Кроме того, Роберт Шалвович (кажется, так
Бибилашвили из Кардиоцентра
работает
над чипами, которые должны одним махом показывать полный паттерн экспресии в
интересующей клеточной культуре/ткани/... . Как там это устроено, я не знаю,
подозреваю, что с мРHК играют, но не уверен.
Чипы, к сожалению, одноразовые, но и это уже круто.
С наилучшими пожеланиями,
Andrey.
aZbystZritsky
inZbox.ru все Z убрать