Инженерам, ничтоже сумняшеся пытающимся заниматься биологией, нужно помнить, что кроме литературы по "квантам" и программированию, нужно читать книжки по биологии.
Хотя бы вот эти:
Проблема белка Том 2. Пространственное строение белка
Е. М. Попов, В. В. Демин, Е. Д. Шибанова
Наука; 1996; 480с.; ISBN 5020016977
Коллективная монография посвящена экспериментальным и концептуальным исследованиям пространственного строения белковых молекул с момента возникновения работ в этой области и по сегодняшний день. Книга состоит из трёх частей. В первой части рассмотрены исследования трехмерных структур белков. Во второй части проанализированы эмпирические подходы к предсказанию вторичной, супервторичной и третичной структур белковых молекул. В третьей части обсуждены механизмы спонтанной укладки белка в нативную конформацию. Значительное внимание уделено общим вопросам термодинамики и кинетики свертывания белковой цепи, изложена общая теория структурной самоорганизации белка, основанная на нелинейной неравновесной термодинамике.
Проблема белка. Том 3 Структурная организация белка
Е М Попов
Наука; 1997; 604с.; ISBN 5020019119
Монография посвящена рассмотрению существующих подходов к изучению принципов молекулярной структурной организации и механизма свертывания белка в нативную конформацию. Книга состоит из введения и четырёх частей. В первой части изложена бифуркационная теория самосборки полипептидной цепи, физическая конформационная теория и метод априорного расчёта пространственного строения белка по известной аминокислотной последовательности. В других частях рассмотрены конформационные возможности простейших пептидов, сложных олигопептидов и белков. Представлены результаты количественного анализа конформационных состояний большого числа пептидов и низкомолекулярных белков. Изложен подход автора к решению обратной структурной задачи позволяющей целенаправленно конструировать наборы искусственных аналогов, пространственное строение которых выборочно отвечает низкоэнергетическим потенциально биологически активным конформациям природного пептида.
А лучше-эти:
Computational Methods for Protein Folding
Ed. Richard A. Friesner
John Wiley & Sons; 2002; pp344; ISBN: 0471209554
Advances in Chemical Physics Volume 120
Since the first attempts to model proteins on a computer began almost thirty years ago, our understanding of protein structure and dynamics has dramatically increased. Spectroscopic measurement techniques continue to improve in resolution and sensitivity, allowing a wealth of information to be obtained with regard to the kinetics of protein folding and unfolding, and complementing the detailed structural picture of the folded state. Concurrently, algorithms, software, and computational hardware have progressed to the point where both structural and kinetic problems may be studied with a fair degree of realism. Despite these advances, many major challenges remain in understanding protein folding at both the conceptual and practical levels.
Computational Methods for Protein Folding seeks to illuminate recent advances in computational modeling of protein folding in a way that will be useful to physicists, chemists, and chemical physicists. Covering a broad spectrum of computational methods and practices culled from a variety of research fields, the editors present a full range of models that, together, provide a thorough and current description of all aspects of protein folding. A valuable resource for both students and professionals in the field, the book will be of value both as a cutting-edge overview of existing information and as a catalyst for inspiring new studies.
Computational Methods for Protein Folding is the 120th volume in the acclaimed series Advances in Chemical Physics, a compilation of scholarly works dedicated to the dissemination of contemporary advances in chemical physics, edited by Nobel Prize-winner Ilya Prigogine.
Computational Biochemistry and Biophysics
Ed. O.M.Becker, A.D.MacKerell, Jr.B. Roux, M.Watanabe
Marcel Dekker, Inc.; 2002; pp512; ISBN: 082470455X
This comprehensive reference/text presents the most recent theoretical methods and computational techniques in biomolecular research—focusing on a variety of approaches for the treatment of macromolecules, including proteins, nucleic acids, and bilayer membranes.
Furnishing essential concepts in free energy calculations, conformational analysis, reaction rates and transition pathways, Computational Biochemistry and Biophysics
calculates and interpretes biomolecular properties gleaned from computer generated membrane simulations
demonstrates comparative protein structure modeling
outlines computer-aided drug design
discusses Bayesian statistics in molecular and structural biology
explores molecular dynamic and internal coordinate simulation methods
explains the RISM-SCF/MCSCF approach to chemical processes in solutions
Containing over 1600 references and end-of-chapter technical details on computational experimentation in biomolecular systems, Computational Biochemistry and Biophysics is a much-needed reference for computational, physical, organic, medicinal, and pharmaceutical chemists and biochemists; and experimental and theoretical biophysicists and biologists, and an informative text for upper-level undergraduate and graduate students in these disciplines.